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编号:13387473
利用TCGA数据库分析识别胃癌预后相关的特异性miRNA(1)
http://www.100md.com 2019年3月25日 《中国实用医药》 2019年第9期
     【摘要】 目的 探讨特异性miRNA与胃癌预后相关性。方法 从TCGA数据库下载203例胃癌及24个癌旁组织miRNA和mRNA表达谱数据及相应的临床资料。应用 “edgeR”R包分别对比分析癌与癌旁样本miRNAs及mRNA差异性。结合生存资料, 采用KM曲线法进行差异miRNAs及靶基因生存分析。针对筛选出的靶基因进行KEGG信号通路富集分析及GO功能注释。结果 miRNA生存分析结果表明, miR-17, miR-139, miR-323b, miR-365a, miR-551b, miR-7705, miR-877和miR-944与胃癌患者生存时间密切相关。KEGG通路和GO功能分析结果表明, 靶基因主要富集在“pathways in cancer”“MicroRNAs in cancer”, “MAPK signaling pathway”, “cell cycle”以及“apoptosis”等肿瘤相关通路。结论 筛选出关键miRNA及其靶mRNA与胃癌发生、预后密切相关 ......
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